勤務先に、会社を設立して副業がばれる主なケースとしては以下の2つが考えられます。

　①　本人が飲み会の席などでポロっと言ってしまった。
   ②　設立した会社から役員報酬（お給料）を受け取った。

　①はご自身で注意して頂く事にしまして、②の設立した会社から役員報酬（お給料）を受け取った、についてです。
　設立した会社からも役員報酬（お給料）を受け取ると、当然その方の年収は同じ勤務先の同僚と比較し多くなります。
　そうしますと、その方のお給料から天引きされる住民税の額も多くなり、経理の方が不思議に思い副業がばれる可能性があるというものです。

　従いまして、ご自身が設立した新会社から役員報酬（お給料）を受け取らない、若しくは、奥様や第三者のみが給料を受け取る場合には、ばれる可能性が低い言えます。

　現在お勤めしている会社を辞めるつもりはなく、かつ、設立した会社からもお給料が欲しい！とお考えの方は、会社を設立されるのではなく、個人事業主として副業を行うという方法もあります。
　副業を個人事業主として行い、確定申告時に副業の収入から発生する住民税をご自身で払うよう選択すれば、会社に副業がばれる可能性は低いです。

　しかし、何らかのきっかけで会社に副業がばれてしまうことも無いとは言えません。
　会社を設立した場合も、個人事業主として事業を行った場合も、会社にばれる可能性がゼロではないことは、言うまでもありません。